usecでマイクロ秒が得られるので、それを1000.0で割ってroundで四捨五入する。
ctime = Time.now
puts ctime
puts "年：#{ctime.year}"
puts "月：#{ctime.month}"
puts "日：#{ctime.day}"
puts "時：#{ctime.hour}"
puts "分：#{ctime.min}"
puts "秒：#{ctime.sec}"
puts "ミリ秒：#{ (ctime.usec / 1000.0).round }" # ミリ秒
puts "マイクロ秒：#{ ctime.usec}" # マイクロ秒
実行結果
> ruby test.rb
Thu Nov 06 11:00:11 +0900 2008
年：2008
月：11
日：6
時：11
分：0
秒：11
ミリ秒：828
マイクロ秒：828000